Hieronder volgt een lijst met indicaties voor het uitvoeren van een vruchtwaterpunctie of vlokkentest:

• Zwangeren van 36 jaar of ouder in de 18^de zwangerschapsweek. Omdat de meeste onderzoeken tussen de 11de en 16^de week plaatsvinden, wordt in een enkel geval onderzoek aangeboden bij vrouwen die nog 35 jaar zijn en enkele weken later 36 zullen worden.
• Zwangeren die reeds een kind met een chromosoomafwijking hebben (gehad).
• Zwangeren die draagster zijn van een X-gebonden erfelijke ziekte (bijv. X-gebonden mentale retardatie), die niet met behulp van prenataal DNA- of biochemisch onderzoek is vast te stellen.
• Zwangeren die eerder een kind met een aangeboren misvorming hebben (gehad) en bij wie de kans op een chromosomale afwijking verhoogd is.
• Zwangeren bij wie door middel van echoscopisch onderzoek aanwijzingen zijn gevonden voor een foetale misvorming.
• (Aanstaande) ouders, van wie één van de partners drager is van een chromosoomafwijking.
• (Aanstaande) ouders die zelf een neuraal buisdefect hebben of al een kind met een neuraal buisdefect hebben (gehad). Naast de bepaling van het alphafoetoproteine (AFP)-gehalte in het vruchtwater wordt tevens een chromosomenonderzoek verricht.
• Zwangeren die een insuline-afhankelijke diabetes mellitus hebben.
• Zwangeren die valproine (Depakine®) of carbamazepine (Tegretol®) gebruiken als anti-epilepticum.
• Zwangeren, bij wie de maternale serumscreening "positief" is, d.w.z. een verhoogde kans hebben op een kind met een Down-syndroom of een neuraal buisdefect.